No se está ocultando nada
Casi siempre es uno de estos cuatro, en este orden.
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Si acabas de instalarlo o actualizarlo, recarga las pestañas de YouTube que ya tenías abiertas
Chrome solo ejecuta una extensión en las páginas abiertas después de instalarla, así que una pestaña de YouTube que ya estaba abierta no tiene FocusTube para nada hasta que la recargas. Lo mismo pasa justo después de que la extensión se actualiza.
Una vez que está funcionando, no necesitas seguir recargando: activar o desactivar algo se aplica de inmediato en las pestañas abiertas.
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Revisa que el modo no esté en Apagado
Abre el popup y mira la pestaña Modo. En Apagado, todo se muestra en YouTube a propósito, sin importar lo que hayas activado en Configuración. Configuración decide qué se oculta; Modo decide cuándo se aplica eso.
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En Timer, revisa que de verdad haya una sesión activa
Este es el que más confunde a la gente. Elegir Timer no arranca nada por sí solo — solo significa "ocultar cosas mientras haya una sesión de enfoque activa". Hasta que le das a empezar, no hay ninguna sesión corriendo, así que no se oculta nada y la extensión parece que no sirve.
O empieza una sesión, o cambia el modo a Siempre si quieres que tu configuración se aplique todo el tiempo.
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En Horario, revisa que estés dentro de una de tus franjas
La misma idea. Un horario solo se aplica los días y horas que configuraste, así que fuera de esas franjas YouTube se deja tal cual a propósito. Si es sábado y tu horario cubre los días de semana, no se ocultará nada — eso es que está funcionando como lo configuraste.
Si solo quieres que esté siempre activo y no pensar más en esto, pon el modo en Siempre.